УДК 575.22:577.29
AGRIS: F30
МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ ОТЕЧЕСТВЕННЫХ СОРТОВ SOLANUM TUBEROSUM L.
©Печенкина В. А., ORCID: 0000-0003-4241-4482
Пермский государственный национальный исследовательский университет,
г. Пермь, Россия,
©Жуланов А. А., ORCID: 0000-0003-2546-9350
Пермский государственный национальный исследовательский университет,
г. Пермь, Россия,
©Пришнивская Я. В., ORCID: 0000-0003-1513-2682
Пермский государственный национальный исследовательский университет,
г. Пермь, Россия,
©Васильева Ю. С., канд. биол наук, ORCID:0000-0002-2255-2434
Пермский государственный национальный исследовательский университет,
г. Пермь, Россия,
©Боронникова С. В., д- р биол. наук, ORCID: 0000-0002-5498-8160
Пермский государственный национальный исследовательский университет,
г. Пермь, Россия,
Аннотация. Исследованы характеристики 12 сортов картофеля (Solanum tuberosum L., Solanaceae) российского происхождения. Урожайность изученных сортов высока и варьирует в пределах от 25 до 40 т/га; среднее содержание крахмала в клубнях достигает 16%, средняя масса клубней — не менее 10 г. Среди 12 изученных 6 сортов S. tuberosum являются среднеспелыми и 6 — раннеспелыми. Для определения генетического разнообразия сортов S. tuberosum был применен ISSR (Inter Simple Sequence Repeats) — метод анализа полиморфизма ДНК с использованием ПЦР. Из 20 ISSR-праймеров были отобраны 4 наиболее эффективных для изученных сортов S. tuberosum, среди которых два динуклеотидных и два трехнуклеотидных праймера. У изученных сортов установлены 40 ISSR-PСR маркеров. Число амплифицированных ISSR-PCR маркеров S. tuberosum варьировало в зависимости от праймера от 8 (праймер ISSR-5) до 12 (праймер M3) а их размеры — от 210 (ISSR-5) до 1100 (X11) пн. На общую выборку S. tuberosum доля полиморфных локусов составила 0,575, ожидаемая гетерозиготность равна 0,071, определено число эффективных аллелей (ne=1,324). Наибольшие показатели генетического разнообразия отмечены у сорта Чародей S. tuberosum (P95=0,303; HE=0,105; ne=1,189). Генетически менее гетерогенен сорт Отрада (P95=0,161; HE=0,047; ne=1,079). У изученных сортов картофеля выявлено 9 редких ISSR-PCR маркеров, наибольшее их число выявлено у сорта Чародей (R=6). Даны рекомендации по использованию генетического потенциала изученных сортов S. tuberosum.
Ключевые слова: ISSR-PCR маркеры, полиморфизм ДНК, отечественный сорт, Solanum tuberosum L.
Ссылка для цитирования:
Печенкина В. А., Жуланов А. А., Пришнивская Я. В., Васильева Ю. С., Боронникова С. В. Молекулярно-генетический анализ отечественных сортов Solanum tuberosum L. // Бюллетень науки и практики. 2018. Т. 4. №3. С. 11-19. Режим доступа: (дата обращения 15.03.2018). DOI:10.5281/zenodo.1197620
MOLECULAR-GENETIC ANALYSIS OF NATIONAL VARIETIESOF SOLANUM TUBEROSUM L.
©Pechenkina V., ORCID: 0000-0003-4241-4482 Perm State University, Perm, Russia,
©Zhulanov А., ORCID: 0000-0003-2546-9350 Perm State University, Perm, Russia,
©Prishnivskaya Ya., ORCID: 0000-0003-1513-2682 Perm State University, Perm, Russia,
©Vasilieva Yu., Ph.D., ORCID:0000-0002-2255-2434 Perm State University, Perm, Russia,
©Boronnikova S., Dr. habil., ORCID: 0000-0002-5498-8160 Perm State University, Perm, Russia,
Abstract. Trails of 12 varieties of Russian origin Potato (Solanum tuberosum L., Solanaceae), were observed. The yield of researched varieties is high and ranges from 25 to 40 t./ha.; mean concentrations of starch in tubers is 16%, the average mass of tubers is more than 10 g. Among the researched varieties 6 varieties of S. tuberosum are a mid-season high-yield, other 6 varieties are early–ripe. ISSR (Inter-Simple Sequence Repeats) method of polymorphism analysis with using PCR was applied to identify the genetic diversity of varieties. From 20 were selected 4 the most effective ISSR praimers for researched varieties of S. tuberosum, among it there are two dinucleotide and two trinucleotide primers. 40 ISSR-PCR markers of researched varieties were identified. The number of amplified ISSR-PCR markers of S. tuberosum varied depending to primer from 8 (ISSR-5) to 12 (M-3), their size were from 210 (ISSR-5) to 1100 (M-3) bp. For the total sample of S. tuberosum, the proportion of polymorphic loci was 0,575, the expected heterozygosity was 0.071, the number of effective alleles (ne=1.324) was determined. The highest rate of genetic diversity was noted in Charodei S. tuberosum (P95=0.303; HE=0.105; ne=1.189). Genetically less heterogeneous Otrada (P95=0.161; HE=0.047; ne=1.079). 9 rare ISSR-PCR markers in researched varieties were identified, the largest number of them has Charodei (R=6). Recommendations on the use of the genetic capability in researched varieties of S. tuberosum were made.
Keywords: ISSR-PCR markers, DNA polymorphism, domestic varieties, Solanum tuberosum L.
Cite as (APA):
Pechenkina, V., Zhulanov, А., Prishnivskaya, Ya., Vasilieva, Yu., & Boronnikova, S. (2018). Molecular-genetic analysis of national varieties of Solanum tuberosum L. Bulletin of Science and Practice, 4, (3), 11-19 doi:10.5281/zenodo.1197620