Исследование выполнено при финансовой поддержке РФФИ в рамках научного проекта № 18-34-00348/19

УДК 577.21:582.475.2
AGRIS F30    

https://doi.org/10.33619/2414-2948/49/11

 

ОЦЕНКА СОСТОЯНИЯ ГЕНОФОНДА ЗАПАДНОЙ РАСЫ

ЛИСТВЕННИЦЫ СИБИРСКОЙ (LARIX SIBIRICA LEDEB.) УРАЛА

НА ОСНОВАНИИ ПОЛИМОРФИЗМА МИКРОСАТЕЛЛИТНЫХ МАРКЕРОВ

©Васильева Ю. С., ORCID: 0000-0002-2255-2434, канд. биол. наук, Пермский

государственный национальный исследовательский университет, г. Пермь, Россия, yulianechaeva@mail.ru
©Сбоева Я. В., ORCID: 0000-0003-1513-2682, Пермский государственный

национальный исследовательский университет, г. Пермь, Россия, yana_prishnivskaya@mail.ru
©Чертов Н. В., ORCID: 0000-0003-0250-220X, Пермский государственный

национальный исследовательский университет, г. Пермь, Россия, syper.gall@mail.ru
©Жуланов А. А., ORCID: 0000-0003-2546-9350, Пермский государственный

национальный исследовательский университет, г. Пермь, Россия, aumakua.ru@gmail.com

Аннотация. На основании анализа полиморфизма двух типов микросателлитных маркеров (ISSR и SSR) проведена оценка состояния генофондов пятнадцати выборок западной расы лиственницы сибирской L. sibirica из трех районов Урала: Северного, Среднего и Южного. Выявлены параметры генетического разнообразия, установлена его структура на внутрипопуляционном уровне. Для оценки уникальности генофонда использовали коэффициент генетической оригинальности (КГО), анализ которого позволил выявить популяции с типичными и специфичными для региона исследований генофондами. Установлено, что изученные выборки в целом характеризуются высоким уровнем генетического разнообразия. Обнаружено, что наибольшей спецификой характеризуются генофонды выборок с Южного Урала, наименьшие значения КГО, то есть более типичные генофонды, отмечены в североуральских выборках L. sibirica, средними значениями КГО обладают выборки Среднего Урала. Также были обнаружены 3 уникальные аллели в выборках ZIL, BND и KCH, в остальных — уникальных маркеров не выявлено. Для комплексной оценки состояния генофондов популяций все установленные показатели генетического разнообразия переведены в разработанную на примере изученных популяций L. sibirica шкалу оценки состояния генофондов. На основании данных о генетическом разнообразии, полученных с помощью двух типов молекулярных маркеров, установлено, что в удовлетворительном состоянии находятся генофонды десяти изученных популяций L. sibirica, а в пяти отмечены признаки обеднения генофонда. По итогам проведенного исследования даны рекомендации по сохранению генетических ресурсов L. sibirica на Урале.

Ключевые слова: полиморфизм ДНК, генетическое разнообразие, микросателлитные маркеры, ISSR,  SSR, генофонд, Larix sibirica, Урал.

ESTIMATION OF THE GENE POOL STATE OF THE WESTERN RACE

OF SIBERIAN LARCH (LARIX SIBIRICA LEDEB.) IN URALS ON THE BASIS

OF MICROSATELITE MARKERS POLYMORPHISM

©Vasileva Yu., ORCID: 0000-0002-2255-2434, Ph.D., Perm State National Research University, Perm, Russia, yulianechaeva@mail.ru
©Sboeva Ya., ORCID: 0000-0003-1513-2682, Perm State National Research University, Perm, Russia, yana_prishnivskaya@mail.ru
©Chertov N., ORCID: 0000-0003-0250-220X, Perm State National Research University, Perm, Russia, syper.gall@mail.ru
©Zhulanov A., ORCID: 0000-0003-2546-9350, Perm State National Research University, Perm, Russia, aumakua.ru@gmail.com

Abstract. Based on the analysis of the polymorphism of two types of microsatellite markers (ISSR and SSR), the state of gene pools of the fifteen of Siberian larch populations from three regions of the Urals: Northern, Middle and Southern was estimated. The parameters of genetic diversity were revealed, its structure was established at the intrapopulation level. To assess the uniqueness of the gene pool, we used the coefficient of genetic originality (KGO), the analysis of which revealed populations with typical and region-specific gene pools. It was established that the studied samples are generally characterized by a high level of genetic diversity. It was found that the gene pools of samples from the South Urals are characterized by the greatest specificity, the lowest values of KGO, i. e. more typical gene pools, are noted in the North Urals samples of L. sibirica, the average values of KGO are from the samples of the Middle Urals. Also, 3 unique alleles were found in the ZIL, BND, and KCH samples, in the rest, no unique markers were detected. For a comprehensive assessment of the state of the gene pools of populations, all established indicators of genetic diversity have been transferred to the scale for assessing the status of gene pools developed on the example of the studied L. sibirica populations. Based on data on genetic diversity obtained using two types of molecular markers, it was found that the gene pools of ten studied L. sibirica populations are in satisfactory condition, and five have signs of gene pool degradation. Based on the results of the study, recommendations are made on the conservation of L. sibirica genetic resources in the Urals.

 

Keywords: DNA polymorphism, genetic diversity, microsatellite markers, ISSR, SSR, gene pool, Larix sibirica, Urals.

Ссылка для цитирования:

Васильева Ю. С., Сбоева Я. В., Чертов Н. В., Жуланов А. А. Оценка состояния генофонда западной расы лиственницы сибирской (Larix sibirica Ledeb.) Урала на основании полиморфизма микросателлитных маркеров // Бюллетень науки и практики. 2019. Т. 5. №12. С. 98-110. https://doi.org/10.33619/2414-2948/49/11

 

Cite as (APA):

Vasileva, Yu., Sboeva, Ya., Chertov, N., & Zhulanov, A. (2019). Estimation of the Gene Pool State of the Western Race of Siberian Larch (Larix sibirica Ledeb.) in Urals on the Basis of Microsatelite Markers Polymorphism. Bulletin of Science and Practice, 5(12), 98-110. https://doi.org/10.33619/2414-2948/49/11 (in Russian).

© 2015–20 Издательский центр НАУКА И ПРАКТИКА. Сайт создан на Wix.com