Авторы выражают благодарность руководству и коллективу Института Генетических Ресурсов НАН Азербайджана

за предоставленную возможность и поддержку в проведении молекулярно-генетических анализов

 

УДК 63.631:634.5
AGRIS F30    

https://doi.org/10.33619/2414-2948/47/05

 

ГЕНЕТИЧЕСКИЙ ПОЛИМОРФИЗМ CORYLUS AVELLANA L. 
НА МАЛОМ КАВКАЗЕ В ПРЕДЕЛАХ АЗЕРБАЙДЖАНА

©Ибрагимов З. А., д-р с.-х. наук, Азербайджанский государственный аграрный университет, г. Гянджа, Азербайджан 
©Ализаде Р. А., Азербайджанский государственный аграрный университет, г. Гянджа, Азербайджан

Аннотация. Статья посвящена результатам исследования генетического полиморфизма лещины (Corylus avellana (L.) H. Karst.), произрастающей на Малом Кавказе в пределах Азербайджана. В анализах использовано ядерная ДНК, экстрагированная из листового материала. Экстрагирование ДНК, проведение PCR и ISSR анализов проведены по стандартным методикам (CTAB, PCR, ISSR протоколы). По результатам анализов с применением 4 ISSR–праймеров, количество идентифицированных фрагментов составило 42, что соответствует 9–12 локусам на праймер (в среднем 10,8). Из идентифицированных 42 фрагментов, 34 (80,95%) — являются полиморфными, а 8 (19,05%) — мономорфны. Количество полиморфных локусов меняется в пределах 7–10. При наименьшем количестве амплифицированных локусов у праймера UBC811, наибольшее их количество приходится на праймер UBC827. В зависимости от праймера количество амплифицированных полиморфных локусов меняется в пределах 63–90%. Уровень полиморфизма ISSR–праймеров в среднем 86% (75–96%). Среднее значение фактической гетерозиготности (H0) — 0,359; а ожидаемая гетерозиготность (HE) — 0,414. По результатам кластер анализа 70 генотипов лещины объединены в 9 кластерах. Несмотря на то, что популяции дистанционно и орографически достаточно изолированы, что исключает поток генетической информации между ними, результаты кластер анализа показывают, что генотипы разных популяций по показателям генетического сходства объединены в общий субкластер. Это объясняется общностью происхождения лещины в популяциях. Этот вид в далеком прошлом был представлен обширным общим ареалом, который в результате геологических процессов был разобщен. Произошла гомогенная дизъюнкция сплошного ареала. 

Ключевые слова: лещина, популяция, генетический полиморфизм, ISSR-праймеры, кластер анализ.

GENETIC DIVERSITY CORYLUS AVELLANA L. IN LESSER CAUCASUS OF AZERBAIJAN

©Ibragimov Z., Dr. habil., Azerbaijan State Agrarian University, Ganja, Azerbaijan
©Alizade R., Azerbaijan State Agrarian University, Ganja, Azerbaijan

Abstract. The article is devoted to the results of a study of the genetic polymorphism of hazel (Corylus avellana), growing in the Lesser Caucasus within Azerbaijan. For the analyzes used nuclear DNA extracted from sheet material. DNA extraction, PCR and ISSR analyzes were carried out according to standard methods (CTAB, PCR, ISSR protocols). According to the results of analyzes using 4 ISSR primers, the number of identified fragments was 42, which corresponds to 9–12 loci per primer (~10.8). Of the 42 fragments identified, 34 (80.95%) are polymorphic, and 8 (19.05%) are monomorphic. The number of polymorphic loci varies in the range of 7–10. With the smallest number of amplified loci in the UBC811 primer, the largest number of them occurs in the UBC827 primer. Depending on the primer, the number of amplified polymorphic loci varies within 63–90%. The level of ISSR primer polymorphism is on average 86% (75–96%). The average value of the actual heterozygosis (H0) is 0.359, and the expected heterozygosis (HE) is 0.414. According to the results of the cluster analysis, 70 hazel genotypes are combined in 9 clusters. Despite the fact that the populations are remotely and orographically sufficiently isolated, which excludes the flow of genetic information between them, the results of the cluster analysis show that genotypes from different populations are combined into a common sub-cluster in terms of genetic similarity. This is due to the common origin of hazel in populations. In the distant past, this species was represented by an extensive common range, which was fragmented as a result of geological processes. The homogeneous disjunction of the continuous range occurred.

 

Keywords: hazel, population, genetic polymorphism, ISSR primers, cluster analysis.
 

Ссылка для цитирования:
Ибрагимов З. А., Ализаде Р. А. Генетический полиморфизм Corylus avellana L. на Малом Кавказе в пределах Азербайджана // Бюллетень науки и практики. 2019. Т. 5. №10. С. 40-49. https://doi.org/10.33619/2414-2948/47/05

Cite as (APA):
Ibragimov, Z., & Alizade, R. (2019). Genetic Diversity Corylus avellana L. in Lesser Caucasus of Azerbaijan. Bulletin of Science and Practice, 5(10), 40-49. https://doi.org/10.33619/2414-2948/47/05 (in Russian).

 

© 2015–20 Издательский центр НАУКА И ПРАКТИКА. Сайт создан на Wix.com